牙齦腫脹其實是一種炎症，炎症病因主要來自於感染，感染之後機體會釋放很多炎症信號分子.炎症信號分子會導致血管內部滲透壓、通透性發生改變，改變之後，體液會滲透到細胞間隙，也就是細胞和細胞之間，導致牙齦腫脹，壓力增高，炎症分子增多，神經敏感性增加，從而引起疼痛。
另外有些是假性腫脹或是由於增生像腫脹，這種情況下是因為裡面的細胞發生增生，導致牙齦量變多，可能需要通過牙周手術切除的辦法解決。如果只是因為炎症發生腫脹，可以通過牙周基礎治療或基本治療消炎、消腫之後，腫脹可以得到有效緩解。