牙齦腫痛要針對病因來進行對症治療，較常見的是牙齦炎或牙周炎導致的牙齦腫痛，表現為牙齦的充血、水腫，甚至糜爛，口腔衛生較差的患者有肉眼可見的齦上結石和軟垢堆積，探診出血或自發性出血，可探及大量齦下牙石。
非急性炎症期可全口潔治，局部沖洗上藥，給予含漱劑。若是急性炎症期，需局部或全身用藥，待炎症控制後疼痛緩解，再行全口潔治，去除引起感染的刺激源。
急性根尖周炎導致的牙齦腫痛通常有病原牙的存在，如齲齒、外傷、磨耗等，有比較明顯的臨床症狀，要儘快開髓，建立根管引流通道，必要市可給予止痛劑。由智齒萌出導致的冠周炎症，可以局部沖洗上藥，保持口腔清潔。疼痛劇烈導致張口受限，觸及淋巴結腫大的患者可口服抗生素治療，反覆腫脹的患者建議拔除智齒。