牙齦翻瓣術和齦下刮治最大的區別，首先在於前者是在直視狀態下進行清創，後者則是在不能直視的情況下根據醫生經驗，然後採用輕柔手法針對齦下的牙齒進行清潔。其實應該稱為是牙周翻瓣術，一定是在齦下刮治進行大概4-6周以後再進行手術，患者如果是存在牙周炎，一般的診療程序是首先進行潔牙，完成潔牙以後，如果有齦下牙石，且牙周袋比較深，可以進行齦下刮治和根面平整。在齦下刮治和根面平整以後，牙齦會有修復恢復的過程，同時牙齦組織會進行一種改建的過程，大概是需要4-6周，醫生會交代在4-6周以後安排病人進行復診，然後再檢查牙周袋是否仍然超過正常的探診深度，如果超過正常的探診深度就說明牙周底下還有炎症，此時才會進行安排翻瓣術。如果翻瓣術進行刮治完以後，炎症仍然存在就說明牙和牙槽骨形態可能不利於進行菌斑的控制，需要採用翻瓣術，把牙齦和牙槽骨進行翻開，在直視的情況下進行清潔。