呼吸衰竭預後分情況而言，常見肥胖低通氣呼吸功能障礙，通過控制體重，配合無創呼吸治療，預後相對較好。如果是慢阻肺發展到呼吸衰竭狀態，預後相對較差。呼吸衰竭受基礎疾病影響，如果基礎疾病無法較好控制，每年有急性加重，急性加重後肺功能明顯迅速下降，呼吸衰竭明顯加重，預後會越來越差。

如果發生急性肺部疾病導致呼吸衰竭，病情較重、合併症較多，預後相對較差。如果病情較重，但基礎病較少，患者可以及時糾正呼吸衰竭，則預後相對較好。如果患者年紀較大、併發症較多、基礎病較多，預後相對較差。