動脈粥樣硬化主要發生在大動脈，比如主動脈，或者中型動脈，如冠狀動脈、腎動脈、頸動脈、椎動脈。動脈粥樣硬化發生在這些部位主要和血管內膜有關，尤其是這些血管的內膜可受到血壓剪切力等一些因素的影響。

動脈粥樣硬化所累及的動脈往往是一些重要臟器器官動脈，會導致重要臟器功能障礙，可以發生腦卒中、冠心病、心絞痛、心肌梗死、腎功能損害，嚴重者可以出現腎功能衰竭。