Ⅰ型和Ⅱ型呼吸衰竭的治療包括病因的治療，只有改善和控制引起呼吸衰竭的病因，才能使呼吸衰竭得到有效的緩解。

Ⅰ型呼吸衰竭的患者在病因治療的同時要予以適當的氧療，因為此時患者多伴有嚴重的低氧血癥，可以予以鼻導管吸氧或面罩吸氧，以儘快的速度改善患者缺氧的狀態，通常需要高濃度吸氧，部分患者還可以予以呼吸機的輔助呼吸治療。

而針對Ⅱ型呼吸衰竭要改善患者的通氣功能，改善肺泡的有效通氣量，改善患者二氧化碳瀦留的現象，此時多需要予以解痙、平喘，部分患者還需要糖皮質激素的治療。患者的氧療多需要低濃度吸氧，避免高濃度吸氧，還可以予以呼吸機的輔助呼吸等治療。