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結腸炎時腸道黏膜細胞會有水腫、變性等改變，黏膜的通透性就會增加，可以有比較多的蛋白質等大分子物質滲透到腸腔內，白細胞也因為炎性物質的吸引，從腸壁內滲透到腸腔內。這些滲入到腸腔內的白細胞和蛋白質成分，不能被結腸吸收，就可以在腸道內細菌的作用下，聚集形成黏液樣改變，黏液便提示有結腸的炎性改變，不能確定是細菌性感染，還是結腸的免疫功能紊亂所致。
乙狀結腸炎特效藥其實也是有的，主要就是針對乙狀結腸炎的具體類型，採取相應的藥物，可能效果就更好。乙狀結腸炎可以分為細菌性、病毒性、潰瘍性結腸炎等自身免疫性疾病、還有放射性腸炎等，如果是細菌性的腸炎選取相對敏感的抗生素治療就屬於特效藥。