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先天性膽管擴張手術的後遺症，目前在臨床上比較常見的是手術以後的粘連性腸梗阻以及膽道逆行感染。先天性膽道擴張症在我國最多見的是1型，主要是發生於膽總管呈梭狀擴張，一般對於1型的先天性膽總管囊腫，目前臨床手術治療的方式主要是行膽總管囊腫切除，遠端封閉，然後將肝總管與空腸做Roux-en-Y吻合，手術創面比較大，所以手術以後常見的後遺症主要包括兩種。
先天性膽總管擴張症一旦確診，首先建議切除膽總管囊腫，同時做膽管空腸吻合。膽總管擴張症有好多分型，肝內外膽總管擴張Ⅳ型或肝內膽管擴張症，膽總管囊腫局部切除效果不好，反覆感染、反覆出現結石，有些患者需要最終選擇肝移植。
先天性膽管擴張症又稱為先天性膽總管囊腫，一經診斷，必須手術治療，而且越早越好，儘量不要耽誤。如果耽誤時間過長，會增加手術難度，也會增加手術併發症發生。手術方式主要分為開腹手術和腹腔鏡手術，隨 著腹腔鏡技術提高，目前腹腔鏡開展率越來越多，而且對患者非常好。
膽管囊腫是一種先天性膽管發育異常，多見於10歲以下的女性。膽管囊腫的分型，I型是囊腫型，佔80%-90%，膽管呈囊狀或梭形擴張；Ⅱ型是憩室型，佔2%，膽總管一側憩室樣擴張、突出；Ⅲ型是壁內段膽總管囊性膨出；Ⅳ型是膽管多發的囊腫；Ⅴ型是Caroli，表現為多發性的或者單發性的肝內膽管囊腫，臨床上膽管囊腫可出現腹痛、黃疸和腹部包塊等。膽總管一側或整個膽總管呈囊性擴張，囊壁菲薄而外形光滑，囊內密度均勻，呈水樣密度，CT值是0-15Hu，分界清楚。巨大膽管囊腫可突入肝內，肝內膽管不擴張或輕度擴張，與膽總管擴張的程度不成比例。靜脈期注射膽影葡胺，CT掃描見囊腫為均一的高密度，也可僅見部分臟器進入囊腫，提示囊腫與膽管相通，有助於診斷。Caroli的分型，分I型是肝內膽管囊腫，表現為肝外周呈多發大小不等的囊狀低密度，並與膽管相通，囊內可見點狀的高密度，增強掃描明顯強化，此徵為中心點徵，到中心點為門靜脈，囊腫可合併結石，靜脈膽道造影顯示造影劑充盈擴張膽管。
膽管擴張症和膽管擴張是有一定區別的。引起膽管擴張的原因很多，其中有先天性膽管擴張症，指解剖異常引起先天性胰膽管合流異常，從而引起大量的胰液逆流到膽管內，而胰液中含有很多消化酶，刺激引起膽管壁的改變，膽管壓力增加後引起的膽管擴張。部分患者膽管擴張伴有末端狹窄，可引起膽囊癌或膽管癌。所以一旦發現，不管有無梗阻、黃疸，建議把膽中囊腫切除，膽管和空腸做膽腸吻合，以免誘發惡性腫瘤。此外，膽管擴張的原因還有膽囊切除後代償性的膽囊、膽總管擴張或者生理性擴張、結石掉到膽管裡引起的膽管擴張。
膽總管囊腫也稱先天性膽總管擴張，臨床可分為五型，各型處理原則有所不同，如先天性囊腫需將囊腫徹底切除，後進行膽腸內引流。當患者因個體情況不適合做該類手術時，可採取囊腫的外引流和單純囊腫和腸管內引流手術。先天性膽總管囊腫切除加膽管和腸管吻合後，可出現後遺症。第 一、後期出現局部結石。第二、吻合口位置可出現狹窄。膽腸吻合後腸內食物或細菌會逆流引起腸膽道感染。如先天性囊腫切除不全可出現囊腫的復發。
膽總管囊腫又稱先天性膽管擴張症，為一種先天性疾病。由於先天性膽管壁發育異常導致，和膽總管遠端結石或者腫瘤堵塞導致的膽總管繼發性擴張不同。膽總管先天性發育異常的機制目前還不清楚，和以下情況有關：