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骨髓炎分為急性血源性骨髓炎和慢性血源性骨髓炎。急性血源性骨髓炎只要治療得當、發現及時，大多數可以治癒，不會留下明顯的後遺症。慢性化膿性骨髓炎理論可以治癒，但目前臨床上尚缺乏徹底治癒的方法，治療後容易出現復發。
對於慢性骨髓炎，無法通過一次治療而達到治癒的效果，現代醫學沒有方法能夠一次性地將慢性骨髓炎治癒。治癒慢性骨髓炎，首先應做病理化驗和細菌培養，明確慢性骨髓炎的診斷。同時再明確感染的細菌，然後進行手術治療，手術時需要去除竇道 ，將死骨清除，並且在慢性骨髓炎的部位進行鑽孔，從而增加血運。
現在有很多報道，在聯合抗感染、改善局部血液循環，包括局部處理的治療基礎上加用高壓氧治療，對頜骨骨髓炎的治療較為有效。比如放療以後導致的放射性骨髓炎，也是高壓氧治療較有效的疾病。因為高壓氧治療不只對放射性頜骨 骨髓炎有效，對放射性損傷，包括放射性膀胱炎、放射性直腸炎、放射性喉炎、放射性腦炎等都有促進修復的效果。
骨髓炎復發患者多數有骨髓炎病史或受傷史，當骨髓炎發生時，局部出現紅、腫、熱、痛，復發時的典型反應包括體溫升高、局部疼痛、局部肢體功能障礙等。若患者有外傷史、手術史等，首先考慮骨髓炎復發。有病史、體徵後，要做相關實驗室檢測，如血培養，是否有相應的細菌或病毒；影像學檢查，包括CT、X光片，甚至磁共振，都可以進行支撐檢測骨髓炎是否復發。
邊緣性骨髓炎在臨床中主要發生在面部，常見由於細菌、微生物或物理性、化學性因素引起的化膿性骨髓炎，在臨床中又稱為頜骨的骨髓炎。這種骨髓炎因在面部，危險性高，臨床中經常會發現這些部位出現骨髓炎之後，波及顱內感染。在臨床中，其治療主要有以下幾點：
骨穿即骨髓穿刺，骨髓是造血組織，做骨穿的目的是為了明確造血組織有沒有異常。對於診斷血液系統的疾病，骨穿檢查是非常關鍵、非常重要的不能替代的操作。在懷疑患者有急性白血病、再生障礙性貧血或多發性骨髓瘤等造血系統惡性疾病時，都需要做骨髓穿刺 來明確診斷。