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部分胃食管反流患者會出現胸悶和呼吸困難，類似於呼吸系統疾病的症狀，是由於巨大裂孔疝所引起。部分患者是由於食管裂孔疝造成食管下端鬆弛，導致胃內酸水向上反流至食管，引起胃食管反流。對 於合併巨大裂孔疝的患者，由於大部分胃疝入胸腔，佔據胸腔內容積，尤其對於老年患者。當走路、活動，如上樓時便會覺得氣促，主要由於巨大的食管裂孔疝佔據胸腔容積，影響肺的擴張和呼吸，從而導致胸悶和呼吸困難。
胃食管反流通常可造成患者消瘦，臨床上手術過的胃食管反流患者，部分體重可瘦到70-80斤。如果出現體重減輕，但不明確原因，應進一步檢查，排除是否有腫瘤或其他因素造成，避免延誤治療而影響病情。一般造成消瘦的原因具體如下;
胃食管反流患者左側臥位一般感覺較好，而右側臥位更易出現反酸、燒心的症狀。因為左側臥位時胃內液體不易反流至食管而對食管造成灼傷，而右側臥位時胃內酸水易反流至食管底部，造成反酸、燒心症狀。胃食管反流病患者較多，主要是因為胃食管連接部下端鬆弛，原因一般是食管下端括約肌壓力下降。
胃食管反流患者可有胸骨痛、後背同，還可放射到左胸部。此時建議胃食管反流患者服用奧美拉唑，即抑酸藥，但需規律用藥，不可隨意停藥。胃食管反流的治療有國際和國內上的指南，一般建議連續服藥4-8周，生理性反流或者輕度的胃食管反流可達到治癒目的。
部分胃食管反流的患者有咽炎，表現為咽痛、咽喉總有痰，主要是胃內酸水反流至咽喉部對咽喉產生刺激。需從根源進行治療，服用促進排空的藥物如莫沙必利、促胃腸動力藥，可促進食管的廓清功能，將酸水儘早下排。
胃食管反流除反酸、燒心的症狀外，還可導致胃痛。1/3的胃食管反流由食管裂孔疝造成，這部分食管裂孔疝患者可出現胸骨後疼痛、胃部不適。食管裂孔是人體重要解剖結構，每個人均有食管裂孔，直徑一般1.5-2cm，裂孔在膈肌上胸部的位置，食管通過裂孔穿過向下 連接著胃部。
胃食管反流患者一般傾向於頭部墊兩個枕頭睡覺，或使用有坡度的床，睡眠時將頭部輕輕墊起，一般可有效抑制胃內酸反流入食管。胃食管反流嚴重時可影響患者生活質量，尤其是夜間睡眠時反酸、燒心明顯，部分患者直接反酸至氣道內，可出現劇烈咳嗽、哮喘，甚至窒息，少部分患者可出現鼻炎、耳鳴等。
胃食管反流最簡單的無創檢查方法是消化道造影，也可以單純做食管造影。造影檢查一般無需在麻醉下進行，喝完造影劑後查看造影劑是否反流至食管下端，即造影劑是否從胃中反流至食管裡。但單純站立位和造影劑一般不能完全判斷，一般要求患者喝完造影劑後處於頭低腳高位，正常人由於胃食管下端的閥瓣功能，胃內液體不會反至食管。
胃食管反流患者可以吃雞蛋，但要根據雞蛋的具體食用方法，具體問題具體分析，比如患者食用水煮雞蛋通常沒有問題，但患者如果食用油煎雞蛋，便可能產生不良影響。油煎雞蛋比較油膩，油膩的食物到胃內後，可能會減緩胃排空，使食物在胃內停留時間延長，刺激胃酸 分泌，便更容易使胃酸從胃反流到食管，導致食管的炎症。