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肝囊腫是臨床上非常常見的一種肝臟的佔位性病變，大多是先天性的病變。隨著年齡增加，肝囊腫也在增加，特別是女性在育齡期、絕經之前有可能會出現肝囊腫的緩慢增大。一般而言，如果是先天性肝囊腫都會持續終生，不再增大，或者是有緩慢 增大的過程。臨床上肝囊腫自行消失的可能性比較小。肝囊腫即使不會自行消失，但一般對身體也沒有太多的危害，只是一種先天性的發育問題而已。一般不會變成惡性的病變，一般也不會導致破裂，或引起肝臟不舒服的情況，只需要定期複查就可以。
兒童肝囊腫其實和成人肝囊腫大部分情況下都是先天發育的問題，不需要特別關注。因為大部分的肝臟囊腫都比較小，而且數量也不會特別多，這種情況定期複查就可以，因為肝囊腫一般也不會惡變。但是要特別小心出現肝臟囊腫合併腎臟囊腫，有可能 是一種常染色體顯性遺傳，就是遺傳性的肝、腎囊腫疾病。在這種情況下要特別小心，因為這種肝和腎的囊腫會越出越多，會導致腎功能的衰竭。如果進一步增大，肝囊腫可以出現感染，會壓迫肝實質的細胞，肝實質的細胞會壓迫膽管，出現相應的肝臟和腎臟損傷的表現。在這種情況下可能要特別小心，但是一般情況下只需要定期複查就可以。
肝囊腫通常不需要服用藥物，對於多發性的肝囊腫或者是大於一定的程度，如果為7-8cm以上，應考慮到醫院就診，查看是否需要手術治療或者是內科穿刺下治療。內科穿刺下治療複發率比較高，一般情況下建議是手術治療。
肝臟低密度影一般見於肝臟囊腫、脂肪浸潤、血管瘤或者良性腫瘤。具體為何種低密度影，要根據CT和增強CT檢查進一步明確。一般肝臟囊腫、血管瘤或者良性腫瘤不需要處理，有些擴張的膽管在肝臟裡面會形成低密度影。
肝囊腫實際上就是長在肝臟裡像水皰一樣的東西，如果不是很大，一般病人沒有任何感覺。只有當水皰很大了，如達到10cm以上，會凸到肝臟表面來，導致肝包膜粘很緊。肝包膜上是有神經纖維，所以就會有上腹部脹痛不適的表現，這時去檢查做B超或做CT，都可以看到肝臟上有水皰。既然有症狀，就可能需要處理包括B超引導下穿刺、引流，但是這種方法容易復發。B超引導下穿刺引流就是把水吸了，吸乾以後水囊就癟掉了。但是水囊皮沒有去掉，很快囊液又分泌出來，又把水囊脹起來了。所以這種方法治標不治本，雖然創傷比較小。為了根治肝囊腫，沒有腹腔鏡時，還是開很大的口子把水囊皮去掉，把囊液放出來。有腹腔鏡以後打幾個小洞就可以做這個事情，就可以把水囊皮完整切除，然後把水完整放掉，再放引流管就可以結束手術，這種複發率也非常低。
肝癌和肝囊腫實際上是兩個概念，肝癌是惡性，肝囊腫是良性。最簡單的鑑別方法可以從CT上鑑別，因為囊腫是一泡水，CT上顯示密度很低，而且沒有血管強化。而肝癌是實實在在長出來的瘤子，所以在CT上表現有不典型強化陰影實性佔位，與肝囊腫完全 不一樣。