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胃間質瘤和其它腫瘤一樣，都是有可能會復發的，但是復發幾率取決於首次手術胃間質瘤的分期狀態。胃間質瘤是間葉組織來源的腫瘤，分期主要依靠腫瘤的大小以及腫瘤的核分裂象、部位決定。
胃間質瘤術後拉肚子與胃間質瘤本身關係不大。腹瀉的發生主要跟結腸相關，結腸重吸收水分形成糞便。做過胃間質瘤手術之後，如進行胃部分切除、胃大部切除等，隻影響初期的進食量，到後期半年或者1年以上，對營養的攝入已經不存任何障礙了，進食可以 達到正常人一樣的進食，所以本身對於腹瀉沒有太大影響。如果出現胃間質瘤做過手術的患者出現腹瀉，建議行腸鏡檢查，瞭解是否有結腸炎或者是否有不潔飲食，這些情況跟胃間質瘤的關係不大。
胃間質瘤術後輔助治療方法應根據胃間質瘤的復發風險度分級決定。對於高危、中危、低危的患者都要採取術後輔助用藥。用藥的選擇需要根據胃間質瘤術後的基因檢測結果，需要檢測CD117等基因改變。如果沒有特殊的突變，採取的是一線治療用藥，即格列衛來作為 術後的用藥，用藥時間根據風險度的分級，中危、高危，風險度越高持續吃藥的時間越高，直到復發。復發以後藥物不能控制，換二線的用藥索坦。如果索坦使用效果非常好，疾病得到控制可以繼續服用。如果出現復發或者進展，就要調藥的劑量。
胃腺瘤疾病的發病原因，目前在學術界尚沒有一個公認結論。目前認為可能和以下因素有關：1、遺傳因素，在一些病人隨訪中，發現胃腺瘤或者是胃息肉，往往有一定家族聚集性。也就是，在一個家族的直系親屬中，他的發病率會比其他家族高。所以對於在家族中已經發現有相關胃腺瘤或者息肉或胃的其他良性腫瘤的病人，建議病人的直系親屬定期進行胃鏡複查，做到早發現、早診斷、早治療；2、另外一方面因素是飲食因素，很多消化道腫瘤可能和人的飲食習慣相關，這也反映出很多腫瘤在西方國家，也就是高營養、高收入國家和一些貧困的亞非拉國家發病率不同。而這些因素主要包括高鹽，也就是大量鹽分攝入可能會破壞胃黏膜，引起很多黏膜基因水平變異或者是毒素更容易吸收；3、很多食物中含有本身公認的致癌物質，也可以導致胃的良性疾病或惡性腫瘤的發生率增高；4、另外，食物中特殊的或者經食物攝取的一些特殊的細菌病原體，特別是黴菌，也可以導致胃腫瘤發病率提高。
胃腺瘤手術分為內鏡下手術和常規外科手術，內鏡下手術大多數情況下在術後第1天就可以嘗試進流食。根據不同的情況，胃腺瘤有不同的切除程度和切除範圍，會適當延遲進食時間，可能會有1-2天的禁飲食時間。如果腺瘤體積比較大，或者高度懷疑惡變，或者考慮浸潤深度、惡變後浸潤深度 比較深，已經不適合做內鏡下手術切除，這種情況如果採取常規外科手術，術後進食時間可能會晚一些，起碼要等到病人腸道通氣之後，也許到手術後4-5天才可以考慮進食，或者經過腸內營養管給予適當無渣流食。總體來講，病人胃腺瘤手術後，建議飲食有一個逐漸過渡的過程，首先以水為主的無渣流食，之後逐漸過渡到半流食及正常飲食。在這個過程中，飲食應以清淡為主。
胃腺瘤手術分為內鏡下手術和常規外科手術。內鏡下手術很多時候可以在門診完成，但是由於切除範圍比較大、範圍比較深，可能會導致類似於出血、穿孔等等併發症。一般術後有24-48小時的觀察時間，觀察時間過後，病人經口進流食、半流食沒有出現問題後，可以考慮出院。如果採取常規外科手術，做胃大部分切除或者全胃切除之後，要根據外科手術常規，在腸道正常通氣、排便、可以進食後再考慮出院。這個時間比內鏡下手術的術後恢復時間相對長些，一般1周左右或者9-10天可以達到出院標準。對於術前一般情況良好的患者，也就是術前營養水平、活動功能方面都正常的患者，術後可以得到早期鍛鍊，早期恢復，出院時間比平均水平會縮短。但術前存在高齡、營養不良、合併其他心肺疾病的病人，術後運動及恢復存在困難，或者術後出現新的併發症、新的問題，出院時間會相對延長。
診斷明確的胃腺瘤手術，不需要切胃。小的腺瘤如<2cm的腺瘤通過內鏡就能夠把腺瘤切除，甚至不需要開放手術。但是>2cm的腺瘤需要做腺瘤切除術，只把瘤體切除而不需要做胃切除。所以胃腺瘤手術是指腺瘤切除術，如果術前有明確的病理診斷，腺瘤沒有癌變，只需要把瘤體切除即可，不需要切除胃。所以 發現腺瘤後早做手術，能夠很快解除病痛。