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卵巢囊腫和巧克力囊腫是兩種疾病，卵巢囊腫可能是生理性或病理性，生理性囊腫一般是在月經週期中出現的現象，並非新生腫物，一般2-3個月後會自行消退。卵巢囊腫是新生腫瘤，大部分屬於良性，只有個別情況為惡性，一般良性囊腫問題不大，若為惡性囊性變，則存在一定問題。
一般附件是指女性的附件區，指卵巢和輸卵管兩個部分，附件囊腫包括卵巢囊腫和輸卵管系膜囊腫。而單純的卵巢囊腫是指發生在卵巢組實質當中的囊腫，囊性的卵巢囊腫大多數是良性，如果是囊實相間，甚至實性的卵巢囊腫，可能有惡性的幾率。
由於卵巢腫瘤中有較多組織學類型，如上皮性、生殖細胞性、性索間質性，以及轉移來的卵巢腫瘤。如果卵巢囊腫病理報告是交界性的腫瘤時，可根據患者病情、年齡以及對生育的要求進行處理，常見有以下情況：
通過B超觀察囊腫影像，如果發現卵巢囊腫內分隔，不一定是癌變，和癌變沒有直接聯繫。黏液性囊腫容易有分隔，但分隔不代表是癌變，主要觀察分隔的薄厚以及隔上有沒有血流或者乳頭狀組織，如果出現乳頭狀組織則有癌變風險。另外，可以在B超下監測囊腫內血流，如果血流比較豐富，則有癌變 風險，或者囊腫比較大且偏實性，也有癌變可能。
卵巢囊腫30×28mm較小，不嚴重。這種大小的囊腫，通常是生理性囊腫。卵巢囊腫分為生理性囊腫和病理性囊腫，病理性囊腫是卵巢的新生腫物。而生理性囊腫是在月經週期中出現的改變，通常較小，直徑不超過5cm。經過一段時間觀察，如2-3個月觀察後，囊腫可自然消退。30×28mm的囊腫，在 臨床上多數是生理性囊腫。
8cm的卵巢囊腫，無法通過藥物消除。對於8cm的卵巢囊腫，唯一的治療方法就是手術治療。手術治療前需區分囊腫是生理性還是病理性，生理性囊腫通常較小，直徑不超過5cm，經過一段時間觀察會自然消退，所以生理性囊腫不需要手術。
患有卵巢囊腫與服用西洋參並不矛盾，只要體質合適，即使患有卵巢囊腫，也可以適當服用西洋參，但不能通過服用西洋參達到治療卵巢囊腫的目的。西洋參有益氣養陰、清熱生津的作用，通常更適合體質偏熱或者偏陰虛的患者服用，而體質較寒或陽虛的患者不適合服用西洋參，但以上情況與卵巢囊腫沒有直接關聯。
卵巢囊腫5cm，吃中藥不一定能消。通常卵巢囊腫的治療效果，取決於多方面的因素，一是取決於卵巢囊腫的大小，二是與卵巢囊腫的形成原因有關，三是與患者對於中藥的敏感度有一定關聯。對於卵巢囊腫的大小方面而言，直徑≤5cm，可以選擇中藥來治療。
卵巢囊腫可以吃中藥進行調理，但最終治療效果與卵巢囊腫的大小、形成卵巢囊腫的原因，以及患者對中藥的敏感度均有一定關係。中藥調理卵巢囊腫的主要治療原則是活血化瘀和清熱解毒，通常卵巢囊腫大小≤5cm，同時形成原因為單純性炎症，且患者 對於中藥的敏感度較高時，可以達到較理想的治療效果。
容易得卵巢囊腫不是雌激素高，卵巢囊腫的發病原因目前並不清楚。受體內雌激素影響的腫瘤包括子宮肌瘤、子宮內膜癌等，這些疾病與激素有明顯相關性，但卵巢囊腫與雌激素沒有確切相關性。由於卵巢囊腫發生的病因不明，所以對於卵巢囊腫目前也並沒有較好的預防辦法，只能定期進行查體。