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兒童化膿性扁桃體炎中西醫結合的治療效果更好，西醫應用抗生素抗細菌感染，中醫可辨證後以中藥和中醫外治法治療。如果明確是化膿性扁桃體炎，血象和CRP很高，則考慮為鏈球菌感染，一般輸注青黴素或頭孢類抗生素可以起到很好的殺菌作用。如果不及時治療，容易併發鼻竇炎、中耳炎和淋巴結炎等。如果為鏈球菌感染，應注意檢查尿常規，以便及時發現併發的腎臟損害。治療效果不佳時應注意是否有支原體感染，及早換藥，或在開始時檢查是否有支原體感染和病毒感染。
扁桃體摘除的最佳時間並不固定，需考慮手術適應症以及手術禁忌症。扁桃體是人類的免疫器官，對兒童尤為重要，故4歲以下的小兒進行扁桃體摘除手術需慎重。進行手術之前需考慮手術適應症和禁忌症，適應症包括扁桃體炎反覆發作、存在扁桃體周圍膿腫。如 果扁桃體炎發作較為頻繁，1年超過3次以上，尤其連續幾年出現此種情況，可考慮進行扁桃體摘除手術。此外，若扁桃體出現腫瘤，也可考慮切除扁桃體，而其禁忌症如下：
孕期如果出現喉嚨痛，經過檢查排除扁桃體炎、咽峽炎等病理情況，可以通過多喝水、多休息緩解，也可以口服含化片西瓜霜含片。飲食需注意少吃刺激性、辛辣食物，多吃清淡食物、水果。
兒童扁桃體發炎、發燒是兒童比較常見的症狀，發熱的管理目標是減輕發熱產生的不適，改善舒適度，而不是一味地將體溫降到正常。特殊情況下要保護體內臟器，最主要的是要找到患兒發熱的原因。兒童發熱的治療辦法主要有以下幾點 ：1、如果體溫不是特別高，即低熱時可以給予物理降溫，如溫水浴，擦患兒額頭或頸部、腋下彎曲部位；2、如果患兒體溫達到38.5℃以上，要服退燒藥，小兒退燒藥僅可選擇對乙酰氨基酚和布洛芬，不可以用其它退燒藥；3、還可以採用中醫外治法，比如藥浴、灌腸、推拿、針刺、放血療法。需要強調的是，不主張對患兒實施強效物理降溫，比如酒精、冰塊等，而且不用安乃近、阿司匹林、尼美舒利等藥物退熱，對患兒有很大影響。而且反對使用激素退燒，有部分診所會給患兒用激素退燒，導致體溫下降很快。而且現在退燒也不主張對乙酰氨基酚和布洛芬交替使用，2個月以下嬰兒和新生兒禁用解熱鎮痛藥。
扁桃體發炎一般最常見急性化膿性扁桃體炎，急性化膿性扁桃體炎會有全身症狀，尤其是在青少年、嬰幼兒，急性化膿性扁桃體炎的全身症狀較重，比如有高熱、畏寒、倦怠、精神不振。而局部症狀有咽痛、吞嚥困難或造成流涎。
扁桃體是人體呼吸道的第一道門戶，兒童扁桃體發炎實際是由於各種病原體感染，包括細菌、病毒和支原體等病原體感染引起。扁桃體跟上述病原體做鬥爭時，就會腫大、充血，從而引發扁桃體炎，扁桃體炎也是身體跟病菌、病毒等抗 爭的一種方式。