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肛瘻患者做完手術以後3-4天可以回家，但是3-4天時傷口不可能完全癒合，需要患者到醫院定期換藥、複查。換藥時醫生會把外面竇道和裡面竇道完全清潔，不殘留糞渣或者髒東西，可能還要添紗條或者藥膏樣東西促進傷口癒合，也會建議從底部逐漸頂到傷口上方，把傷口填平，才是比較好的癒合狀態。如果單純皮膚長住，底下沒有完全癒合，形成假癒合，會造成手術失敗甚至需要二次手術。
肛瘻術後傷口有分泌物，需明確肛瘻的時間以及做完手術的階段。如果初期做完手術以後有分泌物，是非常正常的情況。做完手術以後，周邊會有炎性組織壞死、膿性分泌物，只要患者沒有嚴重症狀，如局部疼痛劇烈，不需要特殊處理。 假如術後很長時間，幾個月以後周邊還存在分泌物，要分析是膿性分泌物還是直腸黏液，大多數患者有分泌物可能是直腸黏液。
肛瘻外口閉合可以戳破。如果外口閉合以後重新形成膿腫，可以做外口切開引流，即老百姓所說的戳破或者擠破，膿流出來以後就不太疼了，但是切不切開、戳不戳破對於疾病整體進程沒有幫助。患者一旦形成肛瘻，外口閉合以後有可能再次形成膿腫，肛管感染細菌或者糞便殘渣再進到竇道里，如果沒有缺陷口，可能在皮下再形成感染性病灶，如果不戳破，患者可能特別疼。
如果肛瘻手術後兩個月出現肛門潮溼，還有分泌物，多因為肛瘻手術損傷括約肌導致，屬於手術後正常狀態。肛門括約肌受到損傷以後會形成壕溝樣通道，使肛門閉合不良。這時肛門內肛腺分泌的液體會通過小溝壑逐漸溢出到肛門外， 這些酸性腸液溢到肛門外刺激肛門，甚至引起皮炎、肛門瘙癢的感覺。
痔瘡是人類的常見病之一，和肛瘻類似，都發生在肛門周圍。但痔瘡和肛瘻是兩種疾病，痔瘡是因肛管內血管發生曲張、腫大、出血、脫出導致的一類良性疾病，和肛瘻類感染性疾病來源不同，痔瘡不是感染性疾病。
女性發生肛瘻的原因和男性相同，都是由肛腺感染引起，而肛腺感染通常以肛門後位為主。肛門周圍感染由後位肛腺引起的感染比較多見，也有的瘻形呈馬蹄形，向肛門左側、右側蔓延。但女性因為前方有陰道，所以容易出現一種特殊的瘻管，即感染到肛門前位膿腫，很容 易從直腸前壁間隙感染陰道，甚至從陰道破潰形成肛門陰道瘻。
高位複雜性肛瘻是肛瘻中非常複雜的問題，我國常用手術方法是祖國醫學的切開掛線療法，也就是對於周圍組織中瘻道、膿腔進行徹底開放引流。對肛管內的內口和經過括約肌的部分瘻管實行掛線處理，通過肌肉瘻管進行掛線，可以通過線的緊縮和橡皮筋 緊縮使肌肉逐步壞死，通過1-2周時間，掛線肌肉部分緩慢被切斷。隨著一部分肌肉粘連使肛門括約肌保持一定完整性，是保護肛門括約肌必要的措施，也是目前最好的辦法。
肛周膿腫切開引流以後都會形成肛瘻，肛周膿腫主要是來源於肛腺感染。肛周膿腫是在肛門周圍組織中間形成的感染灶，來源是在肛腺破壞以後感染形成的肛周膿腫。肛周膿腫經皮膚引流，高位膿腫、低位膿腫都可以通過皮膚引流到皮膚外，引流到皮膚外以後，膿腫的來源是從肛管肛腺開始。肛管的肛腺沒有得到正確的處理，所以膿腫硬塊則不會消失，必須將所有的病灶都切除、處理，引流、掛線，從而才能夠使硬塊徹底消除。
如果手術後發生排尿困難，一般主張患者先進行熱水坐浴，把肛門傷口泡在熱水裡面，使括約肌能夠很快鬆弛。如果括約肌鬆弛，排尿問題通常很快可以解決。如果通過服藥、物理處理後都不能排尿，此時則需要導尿。所以導尿還是最後一個環節，應儘量 通過通過熱敷、坐浴、止痛順利把尿排出。
肛瘻手術後患者都比較急切，做了手術都希望儘快恢復。但肛瘻手術以後創面恢復需要經過幾個時期，肛瘻手術後前1-2天存在傷口滲出期，滲出期是傷口內膿液和血性分泌物的排洩過程，長短不一。如果是深部肛瘻，排洩期可以在一週，小的肛瘻1-2天可以排淨。當傷口膿液排淨，傷 口則開始癒合。