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對於有生育要求的女性，一般主張術後計劃積極妊娠而非藥物治療。因為該種疾病在術後的半年到一年內極易復發，在此之前的妊娠幾率是非常高的。但是在手術前常規要進行卵巢功能的評估，包括患者的年齡、基礎的FSH、 卵巢竇卵泡的數目、血清AMH的水平檢測，進行綜合評估。同時男方也要進行精液的檢查，評估術後自然妊娠的幾率。如果男方精液嚴重異常，或者手術提示女方子宮內膜異位症的程度較重，盆腔輸卵管的狀態差，卵巢功能開始減退，一般建議術後積極進行輔助生殖技術的助孕方法。但是如果男方精液正常或者輕度異常，女方卵巢功能好，可以考慮直接進行人工授精，或者在生殖專科醫生的指導下，進行半年內的自然受孕。如果適應半年仍未妊娠的，一般主張及早進行輔助生殖技術的干涉，避免疾病復發後的被動。
對於子宮內膜異位症程度特別輕微的患者，可以考慮不用藥物或者手術治療，這類的患者通常檢查是沒有見到明顯的盆腔包塊，可以定期隨訪。但是如果有痛經等一些特發的 情況，可以使用前列腺素的抑制藥物進行緩解疼痛。但是如果有生育要求，一般不主張等待，而是儘量及早的助孕。通常使用藥物或者手術治療，一般建議去生殖專科的醫院，及早的排除其他不孕的異常問題，幫助儘早懷孕，而非慢慢等待。子宮內膜異位症的患者，如果沒有生育要求，病灶範圍比較小，而且症狀不是很明顯的情況下，通常不主張進行藥物的處理和治療。而對於有生育要求的患者，即便沒有症狀或體徵，也不主張慢慢等待治療。
子宮內膜異位症是現在婦科的研究熱點，也是現在患病率比較高的疾病。這個病是慢性的婦科疾病，臨床上把它定義為具有活性的子宮內膜組織出現在子宮內膜以外的部位。目前對該病的發病機制有很多說法，現在比較認可的就是子宮內膜的種植學說，這個病多 發生於生育年齡的女性，青春期前不發病，絕經以後異位的病灶可以逐漸萎縮退化。子宮內膜異位症的主要病理變化是異位的內膜週期性的出血，以及周圍的組織纖維化形成異位結節。子宮內膜異位症最典型的症狀是疼痛，疼痛有三聯徵會出現痛經、性交痛和排便困難，同時往往還伴有不孕、月經失調和盆腔包塊等臨床表現。子宮內膜異位症在育齡期女性的發病率約為10%，子宮內膜異位症如果異位到膀胱，會出現患者週期性的尿頻、尿痛、血尿。腹壁疤痕以及臍部位置出現子宮內膜異位症，就可以出現週期性的局部腫塊以及疼痛。腸道如果出現子宮內膜異位症，患者也可以出現腹痛、腹瀉以及便秘，甚至有可能出現週期性少量便血。異位症內膜侵犯或者壓迫輸尿管時，還可以出現一側腰痛和血尿，但是比較少見。臨床診斷的依據就是育齡期女性出現進行性加劇痛經或者伴有不孕，婦科檢查可以摸到盆腔內有不活動的包塊或痛性結節，結合超聲檢查就可以診斷為子宮內膜異位症。
藥物和手術治療現在是子宮內膜異位症治療的主要手段，根據該病的不同臨床表現和患者特點，採用不同的方法，有的患者採用藥物治療，有的患者採用手術治療，有的患者採用藥物結合手術治療。現在子宮內膜異位症藥物治療的內在機制是抑 制卵巢功能，因此通常有強烈生育願望的女性，就比較少使用藥物治療，藥物還可以採用對症，比如像解熱鎮痛藥物，像芬必得止痛，也可以配合以口服短效避孕藥或者孕三烯酮來治療，或者用Gn-RHa的治療也是比較有效的。但是這種藥物治療，一定要注意長期使用帶來的低雌激素一系列的副作用，長期使用因為可以抑制排卵，引起月經不潮，可以產生陰道乾澀、閉經、潮紅，還有長期應用會導致輕度骨質丟失或者骨痛，也可以伴有陰道分泌物或陰道少量出血，注射局部可以出現疼痛和瘙癢，也有少數會出現藥物不良反應，像頭痛、發熱、瘙癢、皮疹等。孕酮是現在用的比較多的子宮內膜異位症的藥物，類似孕激素的合成藥物，口服孕激素治療用於治療子宮內膜異位症也是比較有效的。大部分患者使用孕酮後疼痛減輕或者消失，但是面臨的問題是停藥以後容易復發。子宮內膜異位症是慢性病，藥物一般治療確實無法根治，長期用藥可以緩解症狀，但是使用藥物一般不建議超過6-12個月，用藥還要考慮年齡、卵巢儲備功能、不孕症持續的時間以及其它不孕因素。
提到子宮內膜異位症，大家首先應該明確什麼是子宮內膜。子宮內膜通常位於宮腔內，受到體內雌孕激素的調節，呈一種週期性的生長和剝脫，同時也就構成了女性每個月的月經來潮。與此同時，子宮內膜也是女性懷孕胚胎種植生長的土壤。但是當子宮內膜的這些組織，包括腺體和間質，出 現在子宮腔以外的部位時，這種疾病就稱為子宮內膜異位症，簡稱內異症。由於子宮內膜異位症是一種激素依賴性的疾病，在自然絕經和人工絕經的過程中，包括一些藥物作用、射線照射、手術切除雙側卵巢之後，異位症的病灶就會出現萎縮、吸收的狀況。同時在一些妊娠或者使用性激素藥物抑制卵巢功能的時候，可能會暫時阻止疾病的進一步發展。這種疾病的發生率是1%-10%，近年來呈一種上升的趨勢。其好發的年齡多見於育齡期的女性，其嚴重程度通常與年齡無關，同時這種疾病的症狀和體徵也和嚴重的程度不成比例。
子宮內膜異位症最常見的好發部位是位於卵巢，同時還有宮骶韌帶、直腸子宮陷凹、子宮後壁下段及盆腔腹膜。當病灶位於卵巢時，通常可以見到大小不定的單發或者多發囊腫，位於一側或者雙側的卵巢，這種囊腫由於內部含有陳舊的血液，又恰恰似巧克力狀黏稠，故又稱為卵巢巧 克力囊腫。由於在月經週期，囊腫內的反覆出血，易與盆腔周圍的組織發生一些炎性的反應及纖維化粘連，故而也是引起患者不孕的原因之一。當病灶位於陰道後穹窿時，常常會出現性交痛、觸痛結節等各種臨床表現。同時該種疾病在部分情況下極少的發生於直腸、膀胱、闌尾，甚至肺部都有可能。
子宮內膜異位症特殊的表現與出現的部位有關，通常而言這些特殊表現一般就是盆腔以外的部位出現跟隨月經來潮的一些週期性的變化，比如局部的疼痛、出血、包塊等等。例如異位病灶位於腸道，則可能出現週期性的少許便血、腹痛、腹瀉、便秘等等各種情況。如果是手 術部位的病灶，則可能出現週期性的疤痕處疼痛，甚至在疤痕部位深部有觸痛性的包塊，常見的即剖腹產的手術疤痕疼痛，在月經來潮時出現。有時位於肺部的疾病，也是可能出現週期性的咯血，一般也是跟月經週期有關係。但是當病灶侵犯到輸卵管，有的時候可能會出現腰痛、血尿，甚至腎盂積水，繼發性的腎臟萎縮等等各種情況。
經常有人會提到，是否有痛經的人群，一定是子宮內膜異位症。臨床上的回答是否定的。因為痛經雖然是子宮內膜異位症常見的症狀之一，但是痛經本身分為原發和繼發性兩種類型，其中原發性的痛經一般常出現於青春期，主要跟月經時期體內前列腺素含量的升高 有關係。當體內前列腺素的含量升高時，引起子宮平滑肌的收縮，血管痙攣，同時血管加壓素等物質的增加，加之個人精神、神經因素的影響，共同導致原發性痛經的發生。而這種原發性痛經的發生，通常而言和生殖器官的疾病本身是沒有任何關係的。而子宮內膜異位症則是一種繼發性的痛經，出現的時間一般是在初潮建立後的數年才發生，而且一般隨著時間的增長，進行性的加重。故而痛經本身不能夠立刻診斷為子宮內膜異位症，而且疼痛的輕重程度也不能作為異位症嚴重程度及病灶大小的判斷指標之一。
子宮內膜異位症國際的金標準是腹腔鏡下發現異位病灶，尤其是針對沒有陽性症狀的體徵不孕患者以及痛經患者。同時手術的好處則是起到治療效果的同時進行手術的分期、疾病的評估以及對後續生育率指數的具體評價，對於有生育要求的女性，起到了後續生育的指導及方法的選擇 ，極為重要。至於其他的輔助檢查的方法，首選是B超檢查，尤其對於婦科方面，陰道B超可以發現卵巢巧克力囊腫大小、數量、部位，對於手術具有重要的指導價值。同時血清生物學CA125的明顯升高也可以作為診斷的指標之一。對於具有深部異位浸潤性的病灶以及陰道B超診斷不明的患者均有意義的。而對於腹痛的患者，術前通常建議要進行泌尿系統的B超檢測，明確泌尿系統是否異常，以進行手術的更準確定位。
通常血清學中生物學的改變是診斷子宮內膜異位症的一種有效手段，但是血清學CA125是一種腫瘤標記物，通常而言其升高與子宮內膜異位症、子宮肌瘤、某些卵巢癌症均相關，但是某些內外科的一些炎性疾病也會使其升高，故而血清學中CA125的升高不一定是診斷子宮內膜異位症的金指標。由於其敏感性和特異性都不是很高，和腹腔鏡這種金指標的診斷指標相比，不能夠作為唯一的單一指標來看。而且其動態的監測CA125對於評估子宮內膜異位症的治療效果，以及發生、發展的變化和預測後續的治療都有一定的幫助，但是千萬不能夠以偏概全，不能僅僅通過血清學CA125是否升高來判斷該種疾病的治療過程是否比較良好。
子宮內膜異位症的治療通常強調的是個體化的差異，對於程度特別輕微的患者，可定期隨訪，不做特殊的處理。如果有痛經的患者，可以使用一些前列腺素的抑制劑去緩解痛經疼痛。但是對於有生育要求的患者，一般不主張慢慢的等待，而是儘量及早建議去計劃妊娠。剩餘的絕大部 分患者一般常見的處理方法分為藥物治療及手術治療兩種方式。第一種，藥物治療，藥物治療的原理一般即為了降低或者抑制體內週期性的激素升高，如使用一些口服的避孕藥、人工合成的高效孕激素、促性腺激素釋放激素等等一些。但是當藥物治療的效果不理想，局部的症狀加重，比如卵巢巧克力囊腫增大或者長時間不孕的時候，則可以考慮手術治療，一般首選的是微創手術腹腔鏡。由於腹腔鏡創傷小，恢復快，同時術中可以為該種疾病的分期進行生育指數的評分，這樣對於有生育要求的女性，術後生育的指導有相當重要的價值。因為該種疾病手術只能夠將肉眼所看到的病灶進行清除，但一些極其微小的病灶，無法完全清除，故而手術後易復發，多半是半年到一年後。因此，對於有計劃生育要求的女性，建議術後儘量到正規的生殖專科進行指導生育的檢查，以免錯失術後的黃金懷孕時間。而對於那些範圍極大的患者，在術前可以先考慮藥物預處理，縮小病灶後方便手術。
子宮內膜異位症引起不孕的原因比較複雜。第一個原因可能是由於子宮內膜異位的病灶，位於卵巢或者子宮韌帶、盆腔腹膜時，卵巢上的實性病變，或者影響卵巢的排卵，黃體功能不足，同時可以引起輸卵管、卵巢的粘連，盆腔周圍的粘連，影響到精、卵結合。同 時子宮內膜異位症本身的免疫異常表達以及炎性因子的表達，整體可以破壞受孕的大環境，故而會導致不孕症的發生。子宮內膜異位症一般好發的年齡通常是在生育期的女性，所以對於合併不孕症的女性，通常會帶有這樣的疾病就診。對於這樣的女性，正常人群一般是1%-10%的發病幾率，而對於合併子宮內膜異位症不孕患者的女性，一般主張儘快就診治療，而不建議慢慢的治療。