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通常絕大部分肺囊腫手術不會存在後遺症，目前手術保障方式較為安全。部分患者可能存在術後咳嗽、切口疼痛等不適表現。因患者體質千差萬別，如果合併基礎疾病，如肺氣腫、呼吸功能不全、糖尿病、冠心病等，及患者存在高齡、體質較弱情況，手術風險性增大。而是否需手術、能否手術等均需交給專業醫生進行評估。
肺囊腫術後疼痛與其它肺部術後疼痛原因相似，原因較為複雜。一般切口疼痛最多見，多與胸壁組織切開、組織損傷及肋間神經受刺激有關。因引流管存在一定粗細才能通暢引流，如果術後引流管沒有拔除，疼痛可能與引流管刺激胸膜有 關。若引流管已經拔除，需考慮是否存在胸膜腔炎症刺激，出現胸膜腔感染。而如果引流液出現渾濁，需考慮胸膜腔感染情況，應及時應用抗感染藥物進行相關細菌培養，針對病因治療。且術後疼痛根據患者體質不同，表現不同。其與有關手術過程中有無對肋間進行牽開，因其對肋間神經刺激程度不同，需視情況給予相應鎮痛處理。
肺膿腫治療週期相對比較長，目前臨床大約需治療6-8周。因為肺膿腫是化膿性壞死性炎症，肺組織可以產生膿腔，膿腔也是一種肺部感染性疾病。此時感染的病原菌可以是厭氧菌，如金黃色葡萄球菌、銅綠假單胞菌或者肺炎克雷伯桿菌。可以通過呼吸道吸入感染，也可以是血液感染。細菌對肺組織造成慢性化膿性空腔或者空洞，稱為肺膿腫。
肺膿腫是由於多種病因引起的肺組織的一種化膿性的病變，早期為化膿性的炎症，進而可以發展成壞死性的膿腫。肺膿腫經常發生於青壯年，而且男性多於女性，很多人是因為在喝酒之後嘔吐、誤吸造成。根據病因可以分為經支氣管感染的肺膿腫、經血源感染的肺膿腫等。還有是由於氣道有異物或者腫瘤阻塞所造成感染才產生的 肺膿腫。肺膿腫也可以根據相關的病原來進行歸類，比如葡萄球菌、厭氧菌或者麴黴菌感染造成的肺膿腫，自廣譜抗生素使用以來肺膿腫的發生率實際上已經減少，因為以前藥物非常少，患肺炎以後得不到及時的診治可能發生肺膿腫，但是現在實際上非常少見。一旦發生肺膿腫會嚴重的侵蝕和損害肺臟甚至會造成肺部的空洞的形成。嚴重的肺膿腫還有可能造成感染中毒性休克，危及生命。慢性肺膿腫也可以長期遷延不愈，造成患者反覆的咯血、呼吸困難、胸痛等症狀，甚至很多患者還需要進行手術的治療。
肺膿腫根據相關的病原進行歸類，如葡萄球菌、厭氧菌和麴黴菌的肺膿腫，自抗生素廣泛使用以來肺膿腫的發生率已經減低。但是還是時常會造成肺膿腫特別是血源性肺膿腫，牙齒的細菌可以入血，扎針灸消毒不乾淨，可以通過刺入皮膚以後刺入血管也可以入 血就會造成血源性肺膿腫。肺膿腫是由於多種病因引起的肺組織的一種化膿性改變，早期是化膿性的炎症進而晚期會形成一種壞死性的膿腫。肺膿腫多發於青壯年，男性可多於女性。根據病原可以由血行感染，也可以由支氣管直接播散感染。
甲硝唑氯化鈉注射液是一種抗菌藥物，主要用於治療各種厭氧菌感染，包括腹腔感染、盆腔感染、肺膿腫、腦膿腫等。15%-30%的病例出現不良反應，以消化道反應最為常見，包括噁心、嘔吐、食慾不振、腹瀉、腹部絞痛，一般不影響治療。需要注意的是本品代謝產物可使尿液呈深紅色，如 果使用該藥過程中出現深紅色尿液，不必過度驚慌。早期妊娠患者應避免使用，特別是妊娠3個月以內的患者，該藥可透過乳汁分泌，因此哺乳期患者應停止哺乳。飲酒的朋友要注意用藥期間應禁止飲酒以及含酒精的飲料，以免產生面部潮紅、搏動性頭痛、噁心、嘔吐等，甚至危及生命的雙硫侖樣反應。具體用藥請結合臨床，以醫生面診指導為準。
替硝唑是第二代硝基咪唑類抗菌藥物，與甲硝唑注射液相比區別不大，副作用上會比甲硝唑小，可以作為甲硝唑的替代品。其作用與甲硝唑一樣，主要是用於治療各種厭氧菌的感染，包括腹腔感染、盆腔感染、肺膿腫、腦膿腫等。不良反應少見而輕微，主要為噁心、嘔吐、上腹 痛、食慾下降及口腔金屬味，可有頭痛、眩暈、皮膚瘙癢、皮疹、便秘及全身不適。注意事項與甲硝唑相似，如妊娠早期、特別是妊娠3個月內的患者應避免應用，哺乳期患者應停止哺乳。用藥期間應禁止飲酒及含有酒精的飲料，以免產生面部潮紅、搏動性頭痛、噁心、嘔吐等雙硫侖樣反應。具體用藥請結合臨床，以醫生面診指導為準。