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子宮內膜異位症患者可以懷孕，大部分患者容易合併不孕症，原因主要是子宮內膜異位症會相應的引起女性患者盆腔內粘連、輸卵管病變、排卵障礙、月經紊亂，所以相對不容易懷孕。
子宮內膜異位症若症狀比較輕可以考慮藥物治療，痛的厲害的患者可以用止痛藥。激素用藥最主要的是避孕藥，服藥3-6個月以後可以比較有效的緩解痛經。子宮內膜異位症導致痛經，特別是月經量多的女性朋友，可以上曼月樂環，用於已婚人群，曼月樂環是激素的反射系統，可以更好的緩解痛經症狀。
子宮內膜異位症會導致女性不孕，子宮內膜異位症患者裡有60%-70%人會出現不孕。子宮內膜異位症有多種表現，常表現為患者卵巢出現巧克力囊腫，患者開始沒有痛經，後來越來越重，即繼發性痛經進行性加重，是患者典型臨床症狀。子宮內膜異 位症造成不孕症的原因有以下幾種：
因子宮內膜異位症而選擇試管嬰兒的患者，成功率相對較高，通常能達50%-60%。因為子宮內膜異位症引起不孕的原因主要為腹腔液中炎性因子、生長因子含量較高，故在進行試管嬰兒前通常採用調節藥物對此部分因子進行 抑制，改善盆腔內環境，提高成功率。對於子宮內膜異位症患者，試管嬰兒也是首選治療方式。
子宮內膜異位症併發症目前臨床見得較多的為疼痛和不孕，疼痛最主要表現是痛經，較多患者月經期間就診時面色蒼白，大汗淋漓，均為痛經導致。除痛經外，部分患者可出現慢性盆腔痛、性交痛、外陰痛等。故性交痛患者不願意同房，此亦為影響不孕的主要因素。所以，子宮內膜異位症另一個主要併發症為不孕，40%-50%子宮內膜異位症患者均合併不孕。
子宮內膜異位症最常見部位是卵巢、子宮和宮骶韌帶，比較常見的部位有卵巢、子宮、宮骶韌帶、子宮壁、壁腹膜和髒腹膜。如果異位病灶位於卵巢，最常見子宮內膜異位囊腫，也就是巧克力囊腫，或異位病灶異位到宮骶韌帶上，在進行婦科檢查時，患者會有明顯觸痛感。
子宮內膜異位症患者若有正常性生活，未採取避孕措施一年以上未懷孕，建議儘早備孕。對有生育要求的患者，卵巢功能較好，但子宮內膜異位症症狀較嚴重，建議考慮手術治療。因通過手術治療，可以切除內膜異位病灶，分解粘連，使盆腔組織結構恢復正常。有助於輸卵管功能恢復，有助於患者懷孕。