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肝內外膽管擴張說明膽管下端有病變，包括結石、腫瘤，是最常見的兩種病變。肝內外膽管擴張表現為全身皮膚、鞏膜黃染，尿顏色變成濃茶色，肝功檢查膽紅素明顯上升，直接膽紅素升高為主，建議找出原因。
肝內膽管結石0.4cm體積較小，但關鍵要明確結石位置，結石在遠端膽管基本排不到體外。位於靠近主膽管例如左肝管或右肝管開口處結石，有可能順膽汁流動方向往下走。但正常膽管和腸管連接部位存在稱為奧迪括約肌的解剖結構 ，這個解剖結構相當於膽汁流出的單向閥門，即通過節律性開放和收縮控制膽汁往腸道流動的量和速度。
肝內膽管結石B超可以檢查出來。部分細小肝內膽管結石通過B超容易漏診，因為B超畢竟存在本身的特異度和靈敏度。建議患者進一步進行核磁或CT檢查評估肝內膽管結石的情況和診斷。B超是作為常規體檢手段當中最常用的一種手段，在B 超影像學肝內膽管結石和肝內鈣化灶兩個疾病鑑別較為困難，也是造成混淆的主要原因。
肝結石手術後可能復發，肝結石手術通常稱為肝內膽管結石手術，肝內膽管結石手術方式包括單純取結石，這種情況下複發率較高，因為導致結石形成的原因可能是肝內膽管先天性異常。所以如果是單純取出結石後，膽管結構異常沒有辦法改變，有可能在經過一段時 間後再形成結石，為在臨床過程中常見的一種情況。
肝內膽管結石如果無症狀，無侷限性膽管擴張的Ⅲ級膽管以上結石，一般可以不做手術，定期觀察即可。常見的肝內膽管結石手術包括肝葉切除，切除範圍包括結石所在部位、狹窄膽管、遠端擴張膽管、膽腸吻合術，膽管內切開取石還有肝移植。不同程度的肝內膽管結石手術方式不同，手術時間也不相同。手術比較簡單的肝內膽管切開取石，時間長度一般在1-1.5小時左右。如果牽涉到肝葉切除，術中手術範圍，手術操作更加困難，時間要增加，估計2-2.5小時左右。
若肝內膽管結石合併膽道狹窄、肝萎縮、膽管癌、肝膿腫、膽道出血，可考慮行肝切除，將長有結石的部分肝臟切除，才能將結石徹底切除。若肝內結石較少位置處於肝內較細的膽管，可利用膽道鏡在肝外膽管做切口，將肝內結石取出。若存在膽石、殘石，術後可利用膽道鏡通過竇道，將殘石取出或利用藥物進行化石，但效果不顯著。另外，減少飲酒及高脂飲食，可以降低肝內膽固醇和膽汁濃度，可以抑制結石形成，或進一步生長。