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原發孔房間隔缺損和繼發孔房間隔缺損在胎兒發育時的機制不一樣。繼發孔房間隔缺損通常是指第一間隔或第二間隔的發育缺失，而導致的房間隔缺損。繼發孔房間隔缺損通常分為上腔型房間隔缺損、中央型房間隔缺損和下腔型房間隔缺損，以及混合型或者靜脈竇型的房間隔缺損。
通常情況下，房間隔缺損的治療方式主要是手術治療，包括介入封堵手術和外科修補手術。如果發現嬰兒有房間隔缺損，要根據缺損大小、臨床症狀決定房間隔缺損治療方法和時間。如果缺損比較小，屬於限制性，一般不需要在 嬰兒期治療，因為這種情況一般沒有很明顯的臨床症狀，也不會影響孩子的生長發育，可通過定期複查擇期手術。